GC-Gehalt-Rechner
Berechnen Sie den GC-Gehalt und AT-Gehalt einer DNA-Sequenz.
Nur die Basen A, T, G und C werden gezählt (Groß-/Kleinschreibung wird ignoriert). Leerzeichen, Zahlen und andere Buchstaben werden ignoriert.
GC-Gehalt
AT-Gehalt
Sequenzlänge
GC-Anzahl (G + C)
AT-Anzahl (A + T)
A / T
G / C
Was ist der GC-Gehalt?
Der GC-Gehalt ist der prozentuale Anteil der Basen in einem DNA- oder RNA-Molekül, die entweder Guanin (G) oder Cytosin (C) sind. Er wird berechnet, indem die Anzahl der G- und C-Basen durch die Gesamtzahl der Basen geteilt und mit 100 multipliziert wird. Der verbleibende Anteil ist der AT-Gehalt - der Anteil der Adenin- (A) und Thymin-Basen (T).
Zum Beispiel hat die Sequenz ATGC je eine Base, sodass ihr GC-Gehalt 50% beträgt. Eine Sequenz wie GGCC besteht ausschließlich aus G und C, was einen GC-Gehalt von 100% ergibt.
Warum der GC-Gehalt wichtig ist
DNA-Stabilität
G und C paaren sich über drei Wasserstoffbrücken, während A und T nur zwei bilden. DNA-Bereiche mit höherem GC-Gehalt sind daher thermisch stabiler und widerstandsfähiger gegen Denaturierung.
Schmelztemperatur
Da GC-Paare stärker sind, erhöht ein höherer GC-Gehalt die Schmelztemperatur (Tm) eines DNA-Doppelstrangs. Dies ist entscheidend beim Entwerfen von PCR-Primern und Sonden, bei denen die Tm für eine zuverlässige Anlagerung abgestimmt werden muss.
Klassifizierung von Organismen
Der GC-Gehalt variiert zwischen Arten und sogar zwischen Genomregionen. Er dient als taxonomischer und phylogenetischer Marker - bakterielle Genome reichen beispielsweise von etwa 20% bis 75% GC, was hilft, Organismen zu unterscheiden.
GC- vs. AT-Basenpaarung
In doppelsträngiger DNA paaren sich die Basen gemäß den Chargaff-Regeln: Guanin paart sich immer mit Cytosin und Adenin immer mit Thymin. Die beiden Paarungstypen unterscheiden sich in ihrer Stärke:
- G ≡ C: drei Wasserstoffbrücken - eine stärkere, stabilere Paarung.
- A = T: zwei Wasserstoffbrücken - eine schwächere, leichter trennbare Paarung.
Aufgrund dieser Komplementarität ergeben GC-Gehalt und AT-Gehalt zusammen immer 100% der gültigen, in einer Sequenz gezählten Basen.
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Bildungshinweis: Dieser GC-Gehalt-Rechner ist für Bildungs- und Informationszwecke gedacht. Er zählt nur die Standard-DNA-Basen A, T, G und C und ignoriert mehrdeutige oder nicht standardmäßige Zeichen. Für Forschung, Diagnostik oder klinische Arbeit überprüfen Sie die Ergebnisse mit etablierten Bioinformatik-Werkzeugen und konsultieren Sie qualifizierte Fachleute.