Calculateur de l’Indice de Diversité de Simpson

Calculez l’indice de diversité de Simpson à partir des données d’abondance des espèces.

Les zéros et les champs vides sont ignorés. Chaque valeur est l’abondance (effectif) d’une espèce.

Ce que Mesure l’Indice de Simpson

L’indice de Simpson quantifie la biodiversité en tenant compte à la fois de la richesse (le nombre d’espèces présentes) et de l’équitabilité (la façon dont les individus se répartissent entre ces espèces). Dans sa forme la plus intuitive, l’indice de diversité de Simpson représente la probabilité que deux individus tirés au hasard dans une communauté appartiennent à des espèces différentes.

Une communauté dominée par une seule espèce présente une faible probabilité que deux individus tirés au hasard diffèrent, et donc une faible diversité. Une communauté où les individus se répartissent uniformément entre de nombreuses espèces présente une forte probabilité que deux individus au hasard diffèrent, et donc une forte diversité. Ce calculateur utilise la forme pour population finie, qui échantillonne sans remise et convient aux données réelles dénombrées.

Les Trois Formes de l’Indice de Simpson

Le même calcul sous-jacent est présenté de trois manières apparentées mais distinctes. Avec ni le nombre d’individus de l’espèce i et N le nombre total d’individus :

Indice de Simpson / Dominance (λ)

λ = Σ [ ni(ni − 1) ] / [ N(N − 1) ]

La probabilité que deux individus choisis au hasard appartiennent à la même espèce. Varie de 0 à 1 ; des valeurs plus élevées signifient une diversité plus faible (plus de dominance).

Indice de Diversité de Simpson (1 − λ)

La probabilité que deux individus choisis au hasard appartiennent à des espèces différentes. Varie de 0 à 1 ; des valeurs plus élevées signifient une plus grande diversité. C’est le résultat mis en avant ci-dessus et le chiffre le plus couramment rapporté.

Indice Réciproque de Simpson (1/λ)

Varie de 1 à S (le nombre d’espèces). Il peut s’interpréter comme le nombre effectif d’espèces également communes. Une valeur de 1 signifie qu’une seule espèce domine totalement ; des valeurs plus élevées indiquent davantage d’espèces — et plus uniformément réparties.

Simpson face à Shannon

L’indice de Simpson et l’indice de Shannon (Shannon-Wiener) sont les deux mesures de diversité les plus utilisées, mais ils mettent l’accent sur des aspects différents d’une communauté :

  • Sensibilité à la dominance : L’indice de Simpson accorde plus de poids aux espèces les plus abondantes (dominantes) et est relativement insensible aux espèces rares. L’indice de Shannon accorde plus de poids aux espèces rares et à la richesse spécifique.
  • Interprétation : La diversité de Simpson a une signification probabiliste claire (probabilité que deux individus diffèrent). L’indice de Shannon est issu de la théorie de l’information (l’incertitude à prédire l’espèce d’un individu au hasard).
  • Étendue : L’indice de diversité de Simpson est borné entre 0 et 1, ce qui facilite la comparaison des communautés. L’indice de Shannon n’a pas de borne supérieure fixe — il croît avec la richesse.
  • Quand l’utiliser : Choisissez l’indice de Simpson lorsque la dominance et l’équitabilité priment ; choisissez l’indice de Shannon lorsque les espèces rares et la richesse globale sont au centre. Rapporter les deux est une pratique courante.

Avertissement : Ce calculateur de l’indice de diversité de Simpson est destiné à des fins éducatives et informatives. Les indices de diversité résument un seul échantillon et dépendent d’un effort d’échantillonnage cohérent et complet ; ils ne tiennent pas compte à eux seuls du biais d’échantillonnage, de la probabilité de détection, de l’échelle spatiale ni des espèces rares non détectées. Pour des évaluations écologiques formelles, consultez des écologues qualifiés et la littérature primaire.